Health Information

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    Vonk FHIR Server 구축

    안녕하세요 씨앤텍 시스템즈 최홍준 연구원입니다. 이번 포스트는 Simplifier에서 개발한 Vonk FHIR Server 구축을 해 보았습니다. 해당 Vonk FHIR Server 구축에 필요한 준비사항부터 말씀드리겠습니다. 1. Visual Studio 2019 Community 2. MariaDB (MySQL) or MS-SQL 3. Vonk-license.json (무료 라이센스) 4. POSTMAN 위 준비사항이 준비 되신분들은 다음과 같은 절차에 Vonk FHIR Server를 구축 하실 수 있습니다. [1.Visual Studio 2019 프로젝트 만들기] 1. ASP .Net Core 웹 어플리케이션을 선택합니다. 2. 프로젝트 이름과 프로젝트 위치를 지정합니다. 3. 프로젝트 구성 선택 ..

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    FHIR란?

    안녕하세요. 씨앤텍시스템즈 박선희 연구원입니다. FHIR( Fast Healthcare Interoperability Resources) 에 대해서 알아보겠습니다. FHIR FHIR ( Fast Heathcare Interoperability Resources )는 HL7 ( Health Level Seven International) 이라는 국제 표준기구에서 만들었고, '자원'이라고 알려진 데이터 형식 및 요소 그리고 의료 데이터 교환을 위한 API 의 표준입니다. FHIR는 이전 버전인 HL7 v2와 v3와 같은 이전 데이터 형식 표준을 기반으로 만들어졌습니다. 하지만 전 버전에 비해 여러 가지 최신 웹 기반 API 기술을 사용하기 때문에 구현하기가 더 쉽습니다. 단순히 의료서비스 제공자와 컴퓨터 간..

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    FHIR Server와 FHIR Client 차이점

    안녕하세요 씨앤텍 시스템즈 최홍준 연구원입니다. 이번 포스트는 FHIR Restful API Server와 Client에 대한 차이점에 대해서 설명하겠습니다. [1. FHIR Server] FHIR Server의 기능은 대표적으로 2가지가 있습니다. 1. Restful API 2. Repository 첫 번째 Restful API 기능은 FHIR 통신을 Restful을 이용하여 통신합니다. * Restful API란 REST라는 아키텍처를 구현하는 웹 서비스를 나타내기 위해 사용되는 용어입니다. HTTP 통신에서는 GET / POST / PUT / DELETE 방식으로 통신을 하는데 해당 통신 방식을 REST에서 다음과 같은 형태로 동작합니다. GET = Select POST = Create PUT = ..

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    FHIR as a Meta Model to Integrate CDM: Development of a Tool and Quantitative Validation Study

    안녕하세요. 씨앤텍 시스템즈 입니다. 이번 글은 FHIR를 메타데이터로 활용하여 CDM간 데이터 공유를 활발히 하는 연구 논문에 대해서 정리해 보았습니다. Journal of Medical Internet Research (JMIR) Medical Informatics에 개제된 논문이며 원 제목은 "Fast Healthcare Interoperability Resources (FHIR) as a Meta Model to Integrate Common Data Models: Development of a Tool and Quantitative Validation Study" 입니다. 공동 저자: Emily Rose Pfaff(1), MS; James Champion(1), BS; Robert Louis B..

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    CDM 5.3버전 샘플데이터를 통한 OMOP-CDM 특징 알아보기 (R

    안녕하세요. 씨앤텍 시스템즈 입니다. 이번 글은 OHDSI 측에서 배포해주는 샘플데이터를 통해 OMOP-CDM의 특징을 관계형 데이터베이스(Relational Database; RDB) 관점에서 알아보도록 하겠습니다. 먼저 관계형 데이터가 무엇인지에 대해서 알아보도록 하겠습니다. 1. 관계형 데이터 모델 (Relational Data Model) ① 정의 l 데이터가 테이블 형태로 표현되며 l 사용자가 데이터를 쉽게 다룰 수 있도록 질의어 (SQL; Structured Query Language) 제공 ② 특징 l 데이터는 정해진 엄격한 데이터 스키마(=structure)를 따라 데이터베이스 테이블에 저장 - 스키마를 준수하지 않는 레코드는 추가할 수 없음 l 데이터는 관계를 통해서 연결된 여러 개의 테..

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    OMOP-CDM 버전 비교: 5.3.1ver vs. 6.0ver

    안녕하세요. 씨앤텍 시스템즈 입니다. 이번 글은 OHDSI의 OMOM-CDM 5.3.1버전과 6.0버전 차이에 대해서 정리해 보았습니다. 5.3.1버전의 공식문서가 18년도 6월 작성되었고 6버전은 10월에 작성되었는데 약 3~4개월되는 짧은 시간에 많은 변화가 있었습니다. 먼저 비교분석한 방법은 ohdsi 깃허브에 올라와있는 cdm 공식문서를 활용하였습니다. 6.0버전: https://github.com/OHDSI/CommonDataModel 1. v5.3.1에는 있지만 v6.0에서는 삭제된 테이블 ATTRIBUTE_DEFINITION, COHORT_ATTRIBUTE, DEATH 테이블은 v6.0에서 더이상 사용되지 않습니다. 다만 DEATH 테이블의 death_date 데이터는 PERSON 테이블에 ..